Penjelasan Logo:
STKPK Bina Insan memiliki lambang berbentuk bunga teratai segi lima berwarna kuning; bertuliskan Sekolah Tinggi Kateketik Pastoral Katolik Bina Insan Samarinda; dengan lingkaran di tengah yang membentuk salib berwarna putih; yang di dalamnya terdapat seekor burung merpati berwarna merah; di atas kumpulan orang berwarna kuning yang sedang duduk di kursi berwarna biru dalam posisi melingkar di atas lantai berwarna hitam; dan di tengah mereka terdapat sebuah buku berwarna biru muda bergambar salib kecil berwarna merah.
Lambang STKPK Bina Insan memiliki makna komitmen sebagai Institusi Pendidikan Tinggi Keagamaan Katolik yang membentuk dan menghasilkan tenaga pendidik di bawah bimbingan Roh Kudus dan kesetiaan kepada ajaran Kitab Suci, Tradisi dan Magisterium Gereja; yang ditopang oleh Pancasila dan Panca Tugas Gereja sebagai dasar dari sifat misioner Gereja.
Lambang STKPK Bina Insan memiliki makna sebagai berikut:
- Bunga teratai segi lima melambangkan lima sila Pancasila yang merupakan dasar hidup berbangsa dan warna dasar kuning pada kelima segi melambangkan Panca Tugas Gereja;
- Salib berwarna putih melambangkan identitas panggilan misioner Gereja yang berlandaskan iman, harapan dan kasih;
- Burung merpati berwarna merah melambangkan Roh Kudus;
- Kumpulan orang berwarna kuning melambangkan sivitas akademika STKPK Bina Insan;
- Kursi berwarna biru melambangkan institusi STKPK Bina Insan;
- Lantai berwarna hitam melambangkan sikap membumi dan kesiap sediaan menjalankan tugas misioner;
- Buku berwarna biru muda melambangkan Kitab Suci, Tradisi dan Magisterium Gereja.
- Gambar salib kecil berwarna merah melambangkan Kristus; dan
- Tuliskan Sekolah Tinggi Kateketik Pastoral Katolik Bina Insan Samarinda melambangkan institusi STKPK Bina Insan.